近五年学院投入近3.5亿元，围绕农牧产业链搭建一流的科技创新平台，建成了国家级水禽基因库、国家级姜曲海猪保种场、江苏高校协同创新中心（现代畜牧与新兽药工程技术中心）、江苏省兽用生物制药高技术研究重点实验室、江苏省企业院士工作站、江苏省畜产品深加工工程技术研究开发中心、江苏省渔业科技创新与成果转化平台等国家级平台2个、省级平台13个、市级平台7个。
1.国家级科技创新平台
| 序号 | 平台名称 | 批准部门 | 建设时间 |
| 1 | 国家级水禽基因库 | 农业部 | 2008年 |
| 2 | 国家级姜曲海猪保种场 | 农业部 | 2008年 |
2.省级科技创新平台
| 序号 | 平台名称 | 批准部门 | 建设时间 |
| 1 | 江苏高校协同创新中心（现代畜牧与新兽药工程技术中心） | 省政府 | 2014年 |
| 2 | 江苏省动物医药创制中心 | 省编办 | 2012年 |
| 3 | 江苏省渔业科技创新与成果转化平台 | 省海洋渔业局 | 2011年 |
| 4 | 江苏省畜禽良种化示范场 | 省农委 | 2011年 |
| 5 | 江苏省畜产品深加工工程技术研究开发中心 | 省教育厅 | 2010年 |
| 6 | 江苏省兽用生物制药高技术研究重点实验室 | 省科技厅 | 2009年 |
| 7 | 江苏省企业院士工作站 | 省科技厅 | 2009年 |
| 8 | 江苏省兽药临床试验研究服务中心 | 省科技厅 | 2008年 |
| 9 | 江苏省农业种质资源公共服务中心 | 省科技厅 | 2006年 |
| 10 | 江苏省兽药代谢动力学服务中心 | 省科技厅 | 2006年 |
| 11 | 江苏省动物药品工程技术研究开发中心 | 省教育厅 | 2004年 |
| 12 | 江苏省动物流行病学研究中心 | 省发改委 | 2004年 |
| 13 | 江苏省宠物（藏獒）繁育中心 | 省农委 | 2004年 |
